Home
Luận văn - báo cáo
Khoa học tự nhiên
Khuếch đại vùng gen ITS – rDNA và vùng Tef các nguồn nấm Trichodema từ đó giải trình tự đoạn DNA khuếch đại, định danh các dòng nấm Trichoderma.spp
Khuếch đại vùng gen ITS – rDNA và vùng Tef các nguồn nấm Trichodema từ đó giải trình tự đoạn DNA khuếch đại, định danh các dòng nấm Trichoderma.spp
BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO
TRƢỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH
BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC
****0O0****
KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP
ĐỊNH DANH NẤM Trichoderma DỰA VÀO TRÌNH TỰ
VÙNG ITS – rDNA VÀ VÙNG TEF
Ngành học: CÔNG NGHỆ SINH HỌC
Niên khóa : 2002 – 2006
Sinh viên thực hiện : LẠI HÀ TỐ HOA
Thành phố Hồ Chí Minh
- Tháng 9/2006
BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO
TRƢỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH
BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC
****0O0****
ĐỊNH DANH NẤM Trichoderma DỰA VÀO TRÌNH TỰ
VÙNG ITS – rDNA VÀ VÙNG TEF
Giáo viên hƣớng dẫn Sinh viên thực hiện
TS. LÊ ĐÌNH ĐÔN LẠI HÀ TỐ HOA
Thành phố Hồ Chí Minh
-Tháng 9/2006-
iii
Lời Cảm Ơn
Em xin chân thành cảm ơn Ban giám hiệu cùng toàn thể các thầy,
cô của trƣờng Đại học Nông Lâm TP. HCM đã tận tình truyền đạt kiến
thức và kinh nghiệm trong suốt 4 năm qua. Đặc biệt TS. Lê Đình Đôn đã
hƣớng dẫn và hỗ trợ cho em rất nhiều để hoàn thành tốt luận văn này.
Em xin chân thành cảm ơn các anh, chị ở phòng Bảo Vệ Thực Vật
(Phòng 118) khu Phƣợng Vỹ Trƣờng Đại học Nông Lâm TP.HCM và các
anh chị ở Phòng Công Nghệ Sinh Học Động- Thực Vật - Trung Tâm Phân
Tích Thí Nghiệm Hoá – Sinh -Trƣờng Đại học Nông Lâm TP.HCM đã
giúp đỡ và động viên em trong suốt khoá luận.
Xin gởi lời cảm ơn đến gia đình, những ngƣời thân và bạn bè đã
giúp đỡ và động viên trong suốt thời gian học tập cũng nhƣ trong quá
trình hoàn thành luận văn này.
iv
TÓM TẮT
LẠI HÀ TỐ HOA, ĐH Nông Lâm TPHCM, Tháng 6-2006. “ĐỊNH DANH NẤM
Trichoderma DỰA VÀO TRÌNH TỰ VÙNG ITS – rDNA VÀ VÙNG TEF”
Tại phòng Bảo vệ thực vật, Khoa nông học trƣờng Đại học Nông Lâm và trung tâm
phân tích thí nghiệm – phòng Công nghệ sinh học Thực vật Đại học Nông Lâm –
TP.HCM.
Thời gian thực hiện đề tài: 20/2/2006 đến 5/2006.
Giáo viên hƣờng dẫn: TS. Lê Đình Đôn.
Nội dung nghiên cứu:
- Phục hồi các dòng nấm Trichoderma đƣợc phân lập từ những địa điểm khác
nhau ở Việt Nam (10 mẫu), các mẫu này chỉ đƣợc định danh dựa vào hình thái
học của các dòng nấm và những dòng Trichoderma của nƣớc ngoài (10 mẫu)
từ những ống nghiệm chứa bào tử.
- Nhân sinh khối, thu sinh khối nấm.
- Ly trích thu DNA.
- Thực hiện phản ứng PCR khuếch đại vùng ITS1 – 5,8 – ITS2 bằng primer
ITS4, ITS5 và khuếch đại vùng tef1 – tef2 bằng primer ElongR, ElongF của
các dòng nấm Trichoderma .
- Đọc trình tự sản phẩm PCR của dòng Trichoderma trên cả vùng khuếch đại
bằng cặp primer ITS4, ITS5 và cặp primer Elong R, Elong F; so sánh với cơ
sở dữ liệu (NCBI) để đánh giá mức độ tƣơng đồng của vùng ITS1-5,8-ITS2 và
vùng tef1 – tef2 từ đó xác định chính xác tên loài của từng dòng nấm.
Kết quả đạt đƣợc:
- Tất cả 20 dòng nấm Trichoderma của Việt Nam và nƣớc ngoài đều phục hồi và
thu đƣợc sinh khối cần cho ly trích DNA nhân sôi nấm.
- Ly trích DNA tổng số.
v
- Chạy PCR bằng cặp primer ITS4, ITS5 và cặp primer Elong R, Elong F trên 4
dòng T
T.
.h
ha
ar
rz
zi
ia
an
nu
um
m
(
(T
T4
4)
),
,
T
T.
.k
ko
on
ni
in
ng
gi
ii
i
(
(T
T6
6)
),
,
T
T.
.a
as
sp
pe
er
re
el
ll
lu
um
m
(
(T
T1
19
9)
),
,
T
Tr
ri
ic
ch
ho
od
de
er
rm
ma
a
s
sp
pp
p.
.
(
(2
2
–
–
4
41
1
–
–
2
2)
)
v
và
à
d
dò
òn
ng
g
T
T.
.h
ha
ar
rz
zi
ia
an
nu
um
m
(
(G
GJ
JS
S
0
00
0-
-3
39
9
–
–
m
mẫ
ẫu
u
T
Tr
ri
ic
ch
ho
od
de
er
rm
ma
a
c
củ
ủa
a
n
nư
ướ
ớc
c
n
ng
go
oà
ài
i
đ
đã
ã
đ
đư
ượ
ợc
c
đ
đị
ịn
nh
h
d
da
an
nh
h)
)
d
dù
ùn
ng
g
l
là
àm
m
m
mẫ
ẫu
u
đ
đố
ối
i
c
ch
hứ
ứn
ng
g
- Tiến hành khuếch đại vùng rDNA – ITS và vùng Tef với 2 cặp primer: ITS1-
ITS2 thu đƣợc sản phẩm khuếch đại có kích thƣớc 670 bp (căn cứ trên thang
ladder), tƣơng tự nhƣ trên đối với cặp primer: ElongR, ElongF thu đƣợc sản phẩm
khuếch đại có kích thƣớc 260 bp (căn cứ trên thang ladder) trên 4 dòng
Trichoderma của Việt Nam và 1 dòng đối chứng của nƣớc ngoài Trichoderma
harzianum.
- Giải đƣợc trình tự vùng ITS1 – 5,8S – ITS2 và vùng Tef của dòng Trichoderma
harzianum (T4)
- So sánh trình tự DNA vùng ITS1 – 5,8S – ITS2 giữa dòng Trichoderma nghiên
cứu với những dòng Trichoderma trên cơ sở dữ liệu NCBI và dựa vào phần mềm
CLUSTALX.
Khẳng định T4: Trichoderma asperellum.
Kích thƣớc của vùng ITS1 – 5,8S – ITS2 là 54 5bp.
Kích thƣớc vùng Tef là 223bp.
Trình tự nucleoted ở vùng ITS1 – 5,8S – ITS2 của dòng Trichoderma
asperellum (T4) của Việt Nam so với dòng Trichoderma asperellum có mức độ
tƣơng đồng là 98%.
Trình tự nucleoted ở vùng Tef1fw – Tef2rev của dòng Trichoderma
asperellum (T4) của Việt Nam so với dòng Trichoderma asperellum có mức độ
tƣơng đồng 98%.
vi
MỤC LỤC
Trang tựa
Lời cảm ơn ................................................................................................................. ....... iii
Tóm tắt .............................................................................................................................. iv
Mục lục .............................................................................................................................. vi
Danh sách chữ viết tắt ....................................................................................................... x
Danh sách các bảng và hình ............................................................................................ xi
PHẦN 1: GIỚI THIỆU VÀ TỔNG QUAN TÀI LIỆU
1.1 Đặt vấn đề ................................................................................................................... 1
1.2 Mục đích nghiên cứu .................................................................................................. 2
1.3 Yêu cầu......................................................................................................................... 2
PHẦN 2: TỔNG QUAN TÀI LIỆU
2.1 Giới thiệu về nấm Trichoderma. ................................................................................ 3
2.1.1 Phân loại ................................................................................................................. 3
2.1.2 Nguồn gốc ................................................................................................................ 3
2.1.3 Đặc điểm hình thái ................................................................................................. 3
2.1.4 Đặc điểm sinh thái ................................................................................................. 4
2.1.5 Cơ chế tác động của nấm trichoderma lên các nấm
gây bệnh cho cây trồng ..................................................................................................... 5
2.1.6 Cơ chế đối kháng của trichoderma: ...................................................................... 6
2.1.6.1 Kháng sinh ...................................................................................................... 6
2.1.6.2 Ký sinh ............................................................................................................. 7
2.1.6.3 Cạnh tranh......................................................................................................... 7
2.1.7 Ứng dụng của nấm Tricoderma trong các lĩnh vực ............................................. 8
2.1.7.1 Lƣơng thực và nguyên liệu sợi......................................................................... 8
2.1.7.2 Chất sinh học ..................................................................................................... 8
có thể bạn quan tâm
Nghiên cứu sự đa dạng về di truyền của các dòng nấm R. solani gây bệnh...
68
1.110
303
Khoa học tự nhiên
68
(New)
Phân tích một số đặc điểm nông học của các dòng có nguồn gốc từ mô sẹ...
82
851
443
Thạc sĩ cao học
82
(New)
Xác định gen Pr1 và tìm sự khác biệt trong trình tự nucleotide của đoạ...
75
711
337
Khoa học tự nhiên
75
(New)
Đánh giá các loại hình sử dụng đất hiện trạng theo các tiểu vùng sinh...
100
865
341
Kinh tế quản lý
100
(New)
SƠ LƯỢC QUA VỀ TRUYỀN HÌNH ĐEN TRẮNG VÀ KHUẾCH ĐẠI HÌNH VÀ ĐÈN HÌNH (V...
79
2.901
1.118
Kỹ thuật
79
(New)
Luận văn thạc sỹ: Tác động của dự án duy trì và phát triển bền vững đế...
144
769
338
Kinh tế - Thương mại
144
(New)
Trình bày mô hình để giải quyết bài toán tổng hợp tin từ các nguồn khá...
66
636
296
Kinh tế quản lý
66
(New)
BG: QUY HOẠCH ĐÔ THỊ BỀN VỮNG - C1: KN VỀ ĐỊNH CƯ
10
698
289
Quy hoạch đô thị
10
(New)
thông tin tài liệu
Công nghệ hoá học phát triển kéo theo việc sản xuất hàng loạt thuốc bảo vệ thực vật từ các loại hoá chất tổng hợp. Chúng ta không thể phủ nhận khả năng diệt trừ sâu bệnh, côn trùng, nấm, vi khuẩn gây bệnh trên cây trồng của những sản phẩm thuốc bảo vệ thực vật có nguồn gốc hoá học là rất nhanh và hiệu quả. Thuốc kích thích sinh trƣởng có nguồn gốc hoá học cũng tác động nhanh chóng lên sự sinh trƣởng của: củ, quả, thân, lá cây trồng. NhƯng hệ lụy của thuốc bảo vệ thực vật và thuốc kích thích sinh trƣởng có nguồn gốc hóa học đó là sự tàn phá nhanh chóng môi trƣờng sinh, gây tình trạng ô nhiễm đất đai, nguồn nƣớc và cả không khí, từ đó gây hại cho sức khoẻ cho con ngƣời và vật nuôi, tiêu diệt cả những loài thiên địch có lợi cho đất đai và cây trồng, làm phá vỡ cân bằng sinh thái giữa các giống loài, gây tình trạng ngộ độc có thể dẫn đến chết ngƣời
Mở rộng để xem thêm
tài liệu mới trong mục này
Tạo chủng Rhodococcus opacus B4 có biểu hiện của enzyme n- alkane monooxygenase tăng so với dòng chƣa biến nạp, bằng cách tạo plasmid chứa gene alkB1/alkB2 rồi chuyển plasmid đó vào R. opacus B4
Khảo sát tỉ lệ nhiễm Coliforms và E. coli trong nƣớc uống, nước giải khát có gas, nước uống có cồn đang lƣu hành trên địa bàn Thành phố Hồ Chí Minh.
Sản xuất được chế phẩm diệt ruồi hiệu quả mà không gây độc đối với con ngƣời và thân thiện với môi trường
Nghiên cứu mới để bảo vệ vi khuẩn probiotic và nâng cao giá trị của sữa chua về chỉ tiêu vi sinh vật.
Sản xuất kháng thể thỏ kháng ovalbumin và tinh chế kháng thể (IgG) kháng ovalbumin
tài liệu hot trong mục này
tài liệu giúp tôi
Nếu bạn không tìm thấy tài liệu mình cần có thể gửi yêu cầu ở đây để chúng tôi tìm giúp bạn!
xem nhiều trong tuần
Giáo trình Quản trị học của Đại học kinh tế quốc dân
Tâm lý xã hội VÀ Hệ tư tưởng
Mẫu slide chủ đề âm nhạc
Tham khảo 12 bài tập nguyên lý thống kê có lời giải
4 đề thi học sinh giỏi Toán lớp 2, có đáp án kèm theo
Các hiệu ứng HTML cho trang web
yêu cầu tài liệu
Giúp bạn tìm tài liệu chưa có
×
