5
Sự tiếp nhận virus xảy ra nhờ sự thực bào qua thụ thể trung gian, với thông tin
của các khoang áo ngoài hoặc bởi sự hòa hợp trực tiếp vào màng tế bào cuả virus và
màng nhân, RNA bộ gen được phóng thích vào tế bào chất. Polyprotein được dịch
mã là tiến trình sau đó và lắp ráp lại thành phức hợp bản sao chuyên biệt của virus.
Điểm cuối của carboxyl hydrophobic của protein E qui định một neo nối với màng,
trong khi mở rông phạm vi bên ngoài được ổn định nhờ cầu nối disulfua xoắn tạo cấu
trúc bậc ba và các vùng kháng thể(I,II và III) là có thể biến đổi có liên quan đến các
yếu tố quyết định tương ứng với các nhóm, phân nhóm và các epitope chuyên biệt
virus và các chức năng sinh học. Nối các hạt virus JE với vài tế bào của hệ thần kinh
trung ương (CNS: central nervous system) có thể liên quan tới sự hiện diện của các
thụ thể truyền tín hiệu thần kinh chuyên biệt. Virus gây bệnh sốt xuất huyết dựa trên
heparin sulfate tế bào của dòng glycosaminoglycan (GAG) thông qua các motif gắn
GAG với protein trong phần cuối carboxyl và bên ngoài các vùng có thể vào được
của vùng I và III . Cơ chế tương tự có thể áp dụng với JE và các flavivirus khác
.Virus chuyên biệt và các epitope trung hòa phản ứng chéo được lập bản đồ các vùng
chuyên biệt của glycoprotein E của flavivirus. Các nghiên cứu sự trung hòa chéo
hoàn chỉnh chỉ ra mối quan hệ kháng nguyên kháng thể mật thiết của Virus JE với
virus SLC, West Nile, Koutangu và Usutu và một số flavivirus được tìm thấy ở
Australia(e.g., Murray Valley encephalitis và Kunjin, Alfuy, Stratford và Kokobera
viruses) và sự phân lớp của chúng tạo thành một phức hợp kháng thể, kháng nguyên
duy nhất. Không có các tương tác chéo của huyết thanh với virus viêm gan C được
khảo sát. Mối quan hệ hóa sinh, kháng nguyên và di truyền của virus JE được phân
lập từ các vùng điạ lý khác nhau và ở các thời điểm khác nhau được so sánh bằng
cách sử dụng các kháng thể đơn dòng và đa dòng, điện di hai chiều trên gel của RNA
hạt virus được phân hủy nhờ ribonuclease và trình tự bộ gen. Sự phát sinh loài của
virus JE dựa trên trình tự nucleotide 240 base của prM của virus, sự phân chia JE
phân lập thành 5 genotyepe phân biệt, với sự phân kì tối đa của 21% giữa các sự
phân tách. Kiểu gen lớn nhất gồm có các virus từ Nhật , Okinawa, Trung Quốc, Đài
Loan, Vietnam, Philippines, Sri Lanka, Ấn Độ và Nepal. Kiểu gen lớn thứ hai được
phân lập từ miền bắc Thái Lan, Malaysia, Sarawak, Australia và Indonesia. Ở
Indonesia phân lập được năm loại, hai từ Java, hai từ Bali và một từ Flores tương tự